İlk yıllarda adı Ege Gençlerbirliği gibi isimlerce bir kaç kez değişti ama kurulduğundan beri kulübün renkleri lacivert-beyaz üçüncü renk ise kırmızı`dır.
Akdeniz`in şimşekleri olarak anılan Fethiyespor, 1983 yılında ilk kez profesyonel lige çıktı ve bundan sonra bir daha hiç amatöre düşmedi.
Fethiyespor tarihinde ilk kez 94-95 sezonunda şu anki başkanı İsmail Öztürk`ün de kaptan olduğu takım büyük bir başarı kaydedip şampiyon olarak 2.lige çıkmıştır. 2.lige iyi başlamasına rağmen ikinci yarıda aldığı mağlubiyetler ve 4 sarı kartlı oyuncu oynattığından dolayı 3 puanı silinerek 1 puan farkla ligden düştü.
Şehirde yaşayan bir çok yabancının da tribünlerde desteklediği Fethiyespor 2005-2006 sezonunda 2. LİG B Kategorisi`ne yükselmeyi başarmıştır.
Maçlarını Fethiye Şehir stadında oynayan Fethiyespor 2005-2006 sezonundan beri 2.Lig’de yer almaktadır.
